L'Institut Necker-Enfants Malades (INEM) est un centre de recherche biomédicale situé sur le campus de l'Hôpital Necker-Enfants Malades. Il dispose de nombreuses plateformes de pointe. Le campus jouit d'une réputation de longue date d'excellence scientifique et a apporté des contributions médicales pionnières majeures (transplantation, biothérapie, thérapie génique). Il offre un environnement dynamique propice à la recherche fondamentale et à l'innovation translationnelle.

Le laboratoire d'accueil

Le laboratoire AI2B, dirigé par Matthieu Mahévas et Pascal Chappert, étudie les réponses immunitaires des lymphocytes B dans des contextes tant physiologiques que pathologiques. 

Le projet

Dans le cadre du projet DIPP-IMMUNE financé par le CER, nous recherchons un bio-informaticien pour rejoindre l'équipe. Le candidat retenu contribuera à l’analyse des données de séquençage d’ARN unicellulaire (RNA-seq) et de transcriptomique spatiale Xenium issues d’échantillons humains, ainsi qu’aux données de séquençage des immunoglobulines (répertoire BCR), un domaine dans lequel le laboratoire dispose d’une expertise approfondie. En étroite collaboration avec les chercheurs postdoctoraux et les doctorants du laboratoire, il ou elle prendra en charge les pipelines d’analyse existants, les maintiendra et les étendra afin de soutenir les développements à venir, et intégrera de nouvelles méthodes issues de la littérature scientifique, adaptées aux besoins de chaque responsable de projet.

Votre profil

Master (ou équivalent) en bio-informatique, en informatique ou en mathématiques appliquées.
Expérience avérée en bio-informatique appliquée aux données génomiques ou transcriptomiques, idéalement au niveau unicellulaire. Excellentes compétences en programmation avec R ; connaissance pratique de Python et bonne maîtrise des pipelines d’analyse des données génomiques, des répertoires de BCR (IgBLAST, IMGT, Immcantation), du scRNA-seq (Seurat) et de la transcriptomique spatiale.
Solides compétences organisationnelles et capacité à présenter des résultats scientifiques de manière claire et concise.
Intérêt sincère pour les questions biologiques et capacité à travailler en étroite collaboration avec des biologistes.
Esprit d’équipe, capacité d’écoute et proactivité, ainsi que capacité à travailler de manière autonome.

Comment postuler

Veuillez envoyer un seul fichier PDF contenant : votre CV (2 pages maximum) / votre lettre de motivation (1 page) / les coordonnées de deux personnes de référence.
Le fichier doit être envoyé à : @email ; @email 

Date de prise de fonction

Date limite de candidature : 1er décembre 2026
Date de prise de fonction : 1er janvier 2027